Оказалось что всё в порядке, просто были очень тяжелые файлы, а GitKraken во время выполнения Fetch --all к сожалению не подает признаков, по этому если нужно подтянуть большие файлы с сервера то нужно просто подождать.
Добавили бы хоть прогресс бар какой нибудь.
По этому если знаете что файлы будут тяжелые то проще через GitBash сделать git fetch --all и лицезреть процентный прогрессбар в консольке)).