Присоединяюсь к автору вопроса. Уточню проблему.
Она появляется, когда в файле пишешь html-код, указываешь div тег и между открывающим и закрывающим тегом div PHPStorm подсвечивает странным цветом зону и не распознаёт PHP-код. Причём если вместо div указать любой другой тег - там всё нормально.