Дисковые операции?
Из наблюдений за своим VPS (CentOS + ISPmanager) — LA сильно возрастает во время бэкапов. tar на больших объемах данных поднимает LA до 3-4, rsync в момент сопоставления файлов поднимает LA до 1-2, rsync во время собственно передачи файлов почти не влияет на LA. В остальное время, когда не снимаются бэкапы, LA не поднимается выше 0,7. Так что возможно у вас как раз статик-кэш увеличивает LA.
CentOS+Plesk — это у вас не в хостинг-центре VPS случайно? Там вообще диски очень тормозные…