Там все написано в документации к этой инфоклинике.
Создаете новый soapclient на основе их wsdl, формируете строку содержащую xml с командой что делать, посылаете её в метод opHl7Message (впрочем от версии к версии метод может меняться)
UPDВот например, нужно добавить нового пациента. В документации такой пример вызова функции
<WEB_CLIENT_ADD>
<MSH>
<MSH.7>
<TS.1>20110302184008</TS.1>
</MSH.7>
<MSH.9>
<MSG.1>WEB</MSG.1>
<MSG.2>CLIENT_ADD</MSG.2>
</MSH.9>
<MSH.10>74C0ACA47AFE4CED2B838996B0DF5821</MSH.10>
<MSH.18>UTF-8</MSH.18>
</MSH>
<CLIENT_ADD_IN>
<LASTNAME>Мосягина</LASTNAME> <!-- Фамилия пациента -->
<FIRSTNAME>Валентина</FIRSTNAME> <!-- Имя пациента -->
<MIDNAME>Митрофановна</MIDNAME> <!-- Отчество пациента -->
<EMAIL>mail@mail.ru</EMAIL> <!-- E-mail -->
<PHONE>1234567</PHONE> <!-- Телефон пациента -->
<BDATE>19310215</BDATE> <!-- Дата рождения -->
<SNILS>123-456-789 64</SNILS> <!-- СНИЛС -->
<!-- Режим поиска пациента в БД. 1 – поиск по ФИО + Дата рождения, -->
<!-- 2 – ФИО + Дата рождения + СНИЛС. -->
<CHECKMODE>2</CHECKMODE>
</CLIENT_ADD_IN>
</WEB_CLIENT_ADD>
что с этим делать?
$xml = 'весь ваш xml из примера';
$options = [
'trace' => 1,
'exceptions' => 1,
'login' => 'логин',
'password' => 'пароль',
];
$client = new SoapClient('url wsdl файла', $options);
$response = $client->__soapCall('opHl7Message', $xml)