Скрипты расширения исполняются в отдельном окружении и не имеют доступа с методам и переменным сайта. Единственное что они могут - это модифицировать DOM. Правда есть одно но, если на сайта используется флеш приложение, то можно звать методы этой флешки.
https://developer.chrome.com/extensions/content_sc...