Darivush

Попробуйте

$criteria->group='t.user_id';

где t.user_id PK модели Users.
Плюс т.к. у вас стоит задача не выбрать все мотивации у юзера можно сделать такой финт: добавить релейшен

'usersMotivation' => array(self::HAS_ONE, 'UsersMotivations', 'userID'),

И использовать тот же самый критерий

$criteria = new CDbCriteria;
$criteria->with = array('usersMotivation');
$criteria->addInCondition('motivationID',array(1,2));

если не ошибаюсь заработает даже без

$criteria->together = true;