1. Сейчас поисковики очень много внимания уделяют поведению пользователей на сайте, т.е. насколько удобно пользоваться на мобилах, если с этим все хорошо, то это влияние будет не столь значительным.
2. Не вижу проблем реализовать, то что вы описали с помощью адаптивной верстки без использования js.