Если сайт работает с двумя базами локально, можно лить с разными префиксами в одну базу и не забыть сменить настройки подключения. Ещё, не забыть сменить домен, если прежде он был 'localhost' (линк ниже).
truemisha.ru/blog/wordpress/sql-queries-domain.html 
