В nomerLog содержится первоначальное значение которое было вычеслено до ввода пользователем.
//keyup уже поздно т.к. изначение уже изменено, можно keypress или keydown
nomer.addEventListener('keypress', logKey);
function logKey(e) {
//e.target -- наш input на который привязан обработчик собственно в nomer у вас лежит он же и можно
// оборатиться к nomer.value, что бы получить текущие значение input
const val = e.target.value;
//e.key содержит собственно значение кнопки нажотой пользователем.
if (val.length === 2 && e.key != 9) {
e.preventDefault();
}
}