Barmunk

потому что это сериализованный массив, его сначала нужно конвертировать, а потом сохранить заново.
Ломается потому что в s:17:"BOOK APPOINTMENT:" 17 это не просто циферки, а кл-во байт в string

пример https://ideone.com/sUlbO2

Как насчет join? То что у вас очень странно выглядит.

50 тысяч это не много.
in имеет лимиты https://stackoverflow.com/questions/1069415/limit-...