Если интеграция с другими сервисами не интересует, то почему именно PHP?
Я, будучи PHP-программистом, всё равно предпочитаю для управления проектом Redmine или Trac, в зависимости от задачи.
Кроме того, даже если и требуется интеграция, Redmine или Trac легко позволят её провести связью через БД. Как раз, сейчас подумываю в одном из своих проектов Trac привязать к PHP-фреймворку.