Почему «в среднем»? Например, в YourKit можно хоть даже в реальном времени выделить некий временной отрезок и посмотреть, что терзало процессор в течение обозначенного времени. Кроме того, всегда есть возможность начать снапшот в удобное время (когда появились тормоза) и завершить его после завершения тормозов.