Во первых, если хотите хостить RU-зоны, то нужен еще IP из другой подсети. Для других зон это не важно и можно все повесить на один IP.
Далее нужно определиться вешать все домены на одни и те же NS-ы (типа ns1-ns2.mynsdomain.com) или для каждого домена создавать свои ns1/ns2. Первый вариант проще.
Еще нужно не забыть, что для COM, NET и прочих зон NS-сервера нужно регистрировать как child-ы, а не просто создать у себя A-записи и все. Это делается в интерфейсе доменного регистратора.
Большую помощь в диагностике вам окажет dig +trace
www.domain.com.
Другие технические моменты по установке можете почитать
здесь.