Для начала необходимо определиться, как разделять задачи между командами. В вашем случае неплохо подходят компоненты. Соответственно, необходимо каждой задаче проставить компонент разработки, дизайна, маркетинга и т. д. Затем создать необходимое количество досок. У каждой доски добавить в фильтр соответсвующий компонент. На каждой доске появятся только те задачи, у которых будет проставлен соответствующий компонент.
Поподробнее можно прочитать в официальной документации:
https://confluence.atlassian.com/jirasoftwareserve...
(вместе со ссылками из Next steps)