Под android не работал, но судя по всему строка
LIBS += C:/qt_projects/-----X-----/boost/1.59.0/libs
лишняя.
Возможно, ниже нужно писать что-то вроде
contains(ANDROID_TARGET_ARCH,x86) {
ANDROID_EXTRA_LIBS += \
L"C:/qt_projects/-----X-----/boost/1.59.0/libs/x86/gnu-5/" \
lboost_atomic \
lboost_chrono \
..........
}
по аналогии со стандартным для qmake добавлением в LIBS (Lпуть - путь к каталогу с либами, lназвание - название библиотеки без lib и .so)
Также не стоит подключать все либы boost сразу, большая часть вам не нужна.
И да, boost и Qt отлично друг с другом уживаются.