Старое ничего не потеряется. Эти цели останутся и будут продолжать отслеживаться, пока установлен код для их трекинга.
Просто с помощью подключения GTM вы создадите еще новые цели, которые вам нужно отслеживать. И они могут подгружаться в аналитику или в ЯМ (если вы настроите их подгрузку, связав аналитику или метрику с GTM).
