Не уверен в корректности, но я бы попробовал JSом менять конкретные правила стилей на нужные или тем же JSом добавлять иды/классы к нужным элементам, стили которых прописаны в файле но добавлен "!important" в конце, чтобы перебить уже назначенные.
Вообще, для начала надо разобраться с источником стилей оформления коментариев, а потом уже решать как их перебивать.
