В автоматическом режиме не подскажу, но как выявить неиспользуемые консрукции — дам рекомендации.
Запускаем Audits в Google Chrome Developer Tools и смотрим секцию "Remove unused CSS rules". Там перечислены все заголовки неиспользуемых инструкций.
Дальше удалять можно либо руками. Либо автоматом со 100% уверенностью, что не будут потерты из CSS файла лишние инстуркции.