AUser0

Но учтите, без вылечивания дыры, через которую это делается - лечение кода бесполезно.

sed -E -i 's@^[[:blank:]]*$_HEADERS = getallheaders.+@@g' filename.php

P.S. Сначала проверьте на каком-нибудь подопытном файле.

Ну всё правильно, консоль переводит * в реальный список файлов. Должно сработать так: rm -rf '*'

Если на сервера есть доступ по ssh - можно архивировать с сохранением архива уже на удалённый сервер. Получится передавать меньше данных, а значит быстрее.

Внутри systemd скорее всего пустой env, поэтому не находит сам ssh. Укажите полный путь к ssh в GIT_SSH_COMMAND=/path/to/ssh

Я не спец в python, но кое-что подсказать могу:

stdin, stdout, stderr = self.client.exec_command("echo 'pwd ; exit' | pct enter 81103", get_pty=True)

Ну и объяснение: IMHO, exec_command выполняет команду и ждет её завершения, что-бы вернуть результат. А у вас там interactive shell, которому никто команд не даёт, тем более команд на закрытие самого shell-а. Или делайте invoke_shell и send, или вот таким способом.

P.S. пример для подражания

У ssh есть описанный в документации аргумент -i <id_rsa.file>

Сначала скоруйте содержимое mikrotik/.ssh/.id2_rsa.pub в файл 178.154.249.68:/home/ainar/.ssh/.authorized_keys, а уж потом пытайтесь использовать этот publickey.

В сторону запуска реального, настоящего SOCKS4 или SOCKS5 прокси на свободном (например 8080) порту вместо 22-го, который используется по умолчанию для SSH.
Если нет у вас SOCKS5 PROXY на локальном 22-ом порту, то зачем в него стучаться?