В атрибуте store модели Phones добавьте related_name:
class Phones(models.Model):
phone = models.CharField(max_length=50)
store = models.ForeignKey(Store, related_name='phone_number')
После этого Вы сможете из модели Store достучаться до телефона вот так:
store = Store.objects.get(pk=1)
phone_num = store.phone_number.phone
Также Вы можете использовать связное имя в шаблонах. Как то так...
{% if stores %}
<div class="footer-col-2">
<div class="col-name">Наши магазины</div>
<ul class='stores'>
{% for store in stores %}
<li>
<span>{{ store.name }} - {{ store.address }}</span>
<ul>
<li>{{ store.phone_number.name }}: {{ store.phone_number.phone }}</li>
</ul>
</li>
{% endfor %}
</ul>
</div>
{% endif %}