Верней всего что проблема окружения. Сталкивался с таким когда у меня начинал сыпаться хард на сервере.
Советую замерить скорости выполнения отдельных компонентов
<?php
$start = microtime(true);
//......
echo ( microtime(true) - $start );
Обязательно да чтонибудь всплывёт.