Попробуй зайти в админку в Permalinks и нажать Save, иногда помогает.
Еще как вариант может быть неправильно сконфигурирован Apache: попробуйте добавить это в конфиг апача для папки с сайтом:
<Directory /var/www/>
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews
AllowOverride All
Order allow,deny
allow from all
</Directory>
И не забудь после этого перезагрузить апач:
sudo service apache2 restart 
