AHTOH

Я прочитал, все что советовали до меня. Все верно говорят. Но в данном случае я бы исключил php из цепочки вот каким способом (например):

1. Вы создаете символьные ссылки на все нужные Вам файлы в каталоге (командой ln -s), называя ссылки их ID (как описано в вашем же файле img-links.txt). Нужно только в фоне (руками или по крону) поддерживать актуальность соответствия ссылок нужным файлам (чтобы ссылки соответствовали img-links.txt). Тогда Вам не нужно будет для каждого запроса подгружать php, а можно будет просто отдавать файлы средствами httpd (apache или nginx — не важно).

2. Если ID не имеют расширений, то придется прописывать тип файлов в таблице соответствий (что тоже не сложно).

3. Поддерживаю совет по настройке expire для статики хотя бы на несколько дней (лучше — недель).

В итоге, запросы будут обрабатываться быстрее и, возможно, не будут попадать в дисковый своп и проблема решится. (точно нельзя сказать, не зная параметров хостинга и вашего трафика)

Не работает, потому что RewriteCond работает только со следующим за ним правилом, для объединениz нескольких RewriteCond нужно в конце строки поставить [OR]. И указать, что делать по этой директиве.

Полагаю, вот так все заработает:
# For Friendly URLs
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f [OR]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d [OR]
RewriteCond %{REQUEST_URI} !^/assets/cacheimg
RewriteRule .* — [R=404]
RewriteRule ^(.*)$ /index.php?q=$1 [L,QSA]

2 Гб ОЗУ не слишком много для такого хостинга. В пиковой нагрузке на сервере не заканчивается память случайно? Не через своп начинает работать? Если да, то дешевле будет памяти доставить гигов до 16.