В Asterisk НЕТ возможности менять конфигурацию на ходу, но ЕСТЬ ВОЗМОЖНОСТЬ генерировать конфигурацию скриптом во время (пере)загрузки конкретных конфигурационных файлов. Так что действительно можно в нужный момент делать reload, а собственно конфигурацию генерировать например скриптом.