По руководству, ссылку на которое вы привели, вы как раз настроили работу конференций на АТС, а не на аппарате. Причём с использованием приложения MeetMe, которое уже достаточно давно считается устаревшим и рекомендуется к замене на ConfBridge.
Де-факто все реализации конференций в Asterisk на данный момент или достаточно непростые в реализации или работают не очень интуитивно (а бывает ещё и нестабильно при этом).
Есть опыт реализации конференций на собственно "чистом" Asterisk (без FreePBX), если это остро необходимая функциональность можно обсудить сотрудничество.
P.S. Кстати сказать последняя версия прошивки для этой линейки Cisco(Linksys) 7.5.5, но сначала необходимо обновиться до 7.5.2b, потому что в 7.5.2 как раз есть ошибка, которая мешает обновиться др 7.5.5, а 7.5.2b как раз её исправляет.