Вопрос поставлен не совсем корректно, т.к. может быть 2 трактовки:
1. Если речь идет о веб-скриптах, которые выполняются последовательно, то чем вам не нравится сессия? В данном случае это не костыль — она именно для этого и придумана. Если не нравится непосредственно стандартная реализация, то можно взять собственную (принципиально аналогичную): генерировать ID клиента (сессии) и передавать его через get/post/cookie (по вкусу), а уже сами данные хранить либо в файлах, либо в базе данных, и получать с помощью этого идентификатора в качестве ассоциативного ключа.
Непосредственно данные через куки, гет и пост передавать естественно в данном случае не стоит: эти вещи всегда можно подделать, т.к. они идут через клиента. Это можно назвать костылем :)
================
2. Если же речь идет о выполняющихся одновременно 2 шелл-скриптах, т.е. межпроцессное взаимодействие (IPC), то тут можно использовать разные более или менее системно-зависимых вариантов. От стандартных механизмов IPC: семафоры, сообщения, шаред блок памяти, до специфичных вещей вроде именованного пайпа или сокета; или же аналогичных п.1 вещей (база данных/файлы).
