Как вы «держите» в голове функции, переменные и их значения при написании программы, или разборе чужого кода?

Например, я пытаюсь понять написанную не мной программу. Когда иду сверху вниз по строкам кода, то чем дальше разбираю - из головы один за другим вылетают разные значения, будь то это функции или переменные. Особенно состояния их значений в "настоящее время". Бывает, что пытаешься понять вложенные циклы, или условия и просто физически не можешь отследить ход их работы от "а до я", в какой-то момент тупо забываешь на чем остановился "в данный момент".
У меня проблемы с памятью, или секрет в бумаге с ручкой под рукой?