В настройках /config/nova.php прописал 'domain' = 'nova.site.ru'.
Проблема заключается в том, что поддомен для новы цепляет url, которые в роутинге объявлены для фронтенда. Например, на фронтенде есть url site.ru/list, такой же url создается и для поддомена с nova: nova.site.ru/list.
