project/
apps/
app1/
templates/
list.html
app2/
templates/
list.html
app3/
templates/
index.html
INSTALLED_APPS
и прекратится сразу же, как только будет найдено первое соответствие. Стандартный способ - это завести в templates подкаталоги с тем же именем, что и у приложения:app1/
templates/
app1/
list.html
app2/
templates/
app2/
list.html