У тебя в коде есть require('~./filetools.js'). Node не понимает ~ символ. Если это ссылку на домашнюю директорию, то душе переодевать ее аргументом, к самому скрипту. Если это что-то иное то почитать про глобальные переменные на офф. сайте и про модуль path.