Есть рекомендации по реализации версионности самостоятельно в коде на серверной стороне и на клиенте, несколько подробнее об этом здесь - Работа c облачным бэкендом мобильных приложений в Visual Studio 2013 -
www.techdays.ru/videos/7118.html (там, правда, еще и про другое много), можете сразу презентацию скачать - там все лаконично на слайде.