* 6 */2 * 4
Как по мне, то этот скрипт запускает каждый четверг, если он приходится на четный день месяца, а не каждый второй четверг.
Если же вам нужно пропустить второй четверг, вы можете попробовать указать диапазон дней:
* 6 1-7,15-31 4
То есть вторую неделю вы пропускаете.