Глобальные переменные в большинстве случаев нарушают инкапсуляцию. К ним открыт неконтролируемый доступ отовсюду.
В большом проекте при обилии глобальных переменных возникает путаница в именах. Глобальную переменную же видно отовсюду, надо, чтобы отовсюду было понятно, зачем она.
Глобальные переменные в большинстве случаев нарушают принцип инверсии зависимостей (или делают возможным его нарушение).
Глобальные переменные ухудшают масштабируемость проекта.
Глобальные переменные ухудшают читаемость кода (в каком-то конкретно взятом месте непонятно, нужна ли какая-то конкретная глобальная переменная, или нет).
Глобальные переменные приводят к трудноуловимым ошибкам. Примеры: нежелательное изменение её значения в другом месте/другим потоком, ошибочное использование глобальной переменной для промежуточных вычислений из-за совпадения имен, возвращение функцией неправильного значения при тех же параметрах (оказывается, она зависима от глобальной переменной, а ее кто-то поменял).
Глобальные переменные создают большие сложности при использовании модульного тестирования.
Глобальные переменные увеличивают число прямых и косвенных связей в системе, делая её поведение труднопредсказуемым, а её саму - сложной для понимания и развития.