Использую редактор atom с плагином linter-eslint. Необходимо настроить начальный конфиг. Для linux можно настроить простой командой eslint --init, но как это сделать под windows?
Абсолютно также. Если у вас все правильно установлено, то вам надо выполнить данную команду в корневой папке проекта из консоли (Shell). И дальше просто по шагам все сделаете, и тогда появится файл конфигурации.