Самое лучшее что видел на эту тему - есть tutorial Lynda - Unity 4 2D Essential Training.
Пока что есть на Ютуб. Вот видео:
https://www.youtube.com/watch?v=0VBIc7NZq9E&hd=1
Там надо установить размер юнитов такой как размер тайлов в пикселах: тайлы 100х100 значит юниты 100 пикселов.
Потом добавляется 1 тайл, трансформ позиция задается (0,0,0).
А потом в туториале чувак держит кнопку V на клавиатуре - говорит что это отвечает за Vertex Snapping и вручную ставит тайлы.