Имеет смысл ставить сразу
iojs. 1) Обратно полностью совместимо, по крайней мере на винде и на линуксе в свое время ничего менять не пришлось, чтобы работало. 2) iojs и nodejs сейчас смердживаются, следующая мажорная версия ноды будет иметь номер 4 и будет основана на iojs.