На данный момент роботы не могут выполнять скрипты, не смотря на уже существующие решения. Видимо, слишком дорого для самой машины.
В любом случае, если у вас сайт с динамичной подгрузкой, то для роботов придется отдельно собирать страницы на сервере, а определяют роботов обычно по user-agent.