Python не позволяет работать с памятью напрямую. Очистка происходит сборщиком мусора, когда количество ссылок на объект равно нулю. Например когда ты используешь del ты удаляешь ссылку на объект, то есть счетчик ссылок - 1. и когда он равен нулю, то произойдет полное удаление объекта из памяти.
Что касается работы со стримом данных то его делят на части и процессируют по частям. Пишут в базу, сохраняют в файл, и т.д. Переработал часть, сохранил, удалил, приступил к следующей и т.д.
