Например, у Back4app в панели есть функция Cloud code, в ней загружаешь свой main.js и все. А в parse server этого не нашел. Также не найду каталог где установлен parse server, думал там может найти каталог ./cloud/ и в нее залить main.js.
Сам parse server устанавливал по этой
статье
PS. в начале пытался установить parse server по другой инструкции и с гитхаба, но при запуске приложения по npm выдавалось большое количество варнингов, фиксить пробовал 2/13 и все